CHANGES.rst
LICENSE.rst
MANIFEST.in
README.rst
requirements-optional.txt
requirements.txt
setup.cfg
setup.py
/Users/shyue/repos/pymatgen/scripts/diff_incar.py
/Users/shyue/repos/pymatgen/scripts/feff_input_generation.py
/Users/shyue/repos/pymatgen/scripts/feff_plot_cross_section.py
/Users/shyue/repos/pymatgen/scripts/feff_plot_dos.py
/Users/shyue/repos/pymatgen/scripts/gaussian_analyzer.py
/Users/shyue/repos/pymatgen/scripts/gen_potcar
/Users/shyue/repos/pymatgen/scripts/get_environment.py
/Users/shyue/repos/pymatgen/scripts/pmg
/Users/shyue/repos/pymatgen/scripts/pydii
pymatgen/__init__.py
pymatgen/dao.py
pymatgen.egg-info/PKG-INFO
pymatgen.egg-info/SOURCES.txt
pymatgen.egg-info/dependency_links.txt
pymatgen.egg-info/requires.txt
pymatgen.egg-info/top_level.txt
pymatgen/alchemy/__init__.py
pymatgen/alchemy/filters.py
pymatgen/alchemy/materials.py
pymatgen/alchemy/transmuters.py
pymatgen/analysis/__init__.py
pymatgen/analysis/bond_valence.py
pymatgen/analysis/bvparam_1991.yaml
pymatgen/analysis/diffusion_analyzer.py
pymatgen/analysis/energy_models.py
pymatgen/analysis/eos.py
pymatgen/analysis/ewald.py
pymatgen/analysis/icsd_bv.yaml
pymatgen/analysis/molecule_matcher.py
pymatgen/analysis/molecule_structure_comparator.py
pymatgen/analysis/nmr.py
pymatgen/analysis/piezo.py
pymatgen/analysis/reaction_calculator.py
pymatgen/analysis/structure_analyzer.py
pymatgen/analysis/structure_matcher.py
pymatgen/analysis/substrate_analyzer.py
pymatgen/analysis/thermochemistry.py
pymatgen/analysis/transition_state.py
pymatgen/analysis/chemenv/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/chemenv_strategies.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometry_finder.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/structure_environments.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/voronoi.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/A#2.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/AC#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BO_1#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BO_2#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BO_3#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BS_1#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BS_2#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/C#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/C#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/CO#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DD#20.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DD#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DDPN#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DI#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/ET#7.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/FO#7.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/H#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/H#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HA#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HB#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HD#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HP#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/I#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/L#2.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/MI#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/O#6.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/O#6_explicit.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PA#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PB#7.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PBP#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PCPA#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PP#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PP#5.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PP#6.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#1.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#4.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#5.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SA#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SBSA#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SBT#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SC#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SH#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SMA#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SS#4.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SS#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/ST#7.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SY#4.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/T#4.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/T#5.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/T#6.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TBSA#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TBT#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TC#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TI#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TL#3.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TO_1#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TO_2#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TO_3#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TS#3.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT_1#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT_2#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT_3#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TY#3.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/allcg.txt
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/strategy_files/ImprovedConfidenceCutoffDefaultParameters.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/strategy_files/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/tests/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/tests/test_coordination_geometry_finder.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/tests/test_light_structure_environments.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/tests/test_read_write.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/tests/test_voronoi.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/chemenv_config.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/chemenv_errors.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/coordination_geometry_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/defs_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/func_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/math_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/scripts_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/tests/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/tests/test_coordination_geometry_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/tests/test_func_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/tests/test_math_utils.py
pymatgen/analysis/cost/__init__.py
pymatgen/analysis/cost/cost.py
pymatgen/analysis/defects/__init__.py
pymatgen/analysis/defects/dilute_solution_model.py
pymatgen/analysis/defects/ionic_radii.json
pymatgen/analysis/defects/point_defects.py
pymatgen/analysis/defects/surf_error.py
pymatgen/analysis/diffraction/__init__.py
pymatgen/analysis/diffraction/atomic_scattering_params.json
pymatgen/analysis/diffraction/xrd.py
pymatgen/analysis/elasticity/__init__.py
pymatgen/analysis/elasticity/elastic.py
pymatgen/analysis/elasticity/strain.py
pymatgen/analysis/elasticity/stress.py
pymatgen/analysis/elasticity/tensors.py
pymatgen/analysis/hhi/__init__.py
pymatgen/analysis/hhi/hhi.py
pymatgen/analysis/pourbaix/__init__.py
pymatgen/analysis/pourbaix/analyzer.py
pymatgen/analysis/pourbaix/entry.py
pymatgen/analysis/pourbaix/maker.py
pymatgen/analysis/pourbaix/plotter.py
pymatgen/apps/__init__.py
pymatgen/apps/battery/__init__.py
pymatgen/apps/battery/analyzer.py
pymatgen/apps/battery/battery_abc.py
pymatgen/apps/battery/conversion_battery.py
pymatgen/apps/battery/insertion_battery.py
pymatgen/apps/battery/plotter.py
pymatgen/apps/borg/__init__.py
pymatgen/apps/borg/hive.py
pymatgen/apps/borg/queen.py
pymatgen/command_line/OxideTersoffPotentials
pymatgen/command_line/__init__.py
pymatgen/command_line/aconvasp_caller.py
pymatgen/command_line/bader_caller.py
pymatgen/command_line/enumlib_caller.py
pymatgen/command_line/gulp_caller.py
pymatgen/core/__init__.py
pymatgen/core/bond_lengths.json
pymatgen/core/bonds.py
pymatgen/core/composition.py
pymatgen/core/func_groups.json
pymatgen/core/ion.py
pymatgen/core/lattice.py
pymatgen/core/libxc_docs.json
pymatgen/core/libxcfunc.py
pymatgen/core/operations.py
pymatgen/core/periodic_table.json
pymatgen/core/periodic_table.py
pymatgen/core/physical_constants.py
pymatgen/core/sites.py
pymatgen/core/structure.py
pymatgen/core/surface.py
pymatgen/core/units.py
pymatgen/core/xcfunc.py
pymatgen/electronic_structure/__init__.py
pymatgen/electronic_structure/bandstructure.py
pymatgen/electronic_structure/boltztrap.py
pymatgen/electronic_structure/core.py
pymatgen/electronic_structure/dos.py
pymatgen/electronic_structure/plotter.py
pymatgen/entries/MITCompatibility.yaml
pymatgen/entries/MPCompatibility.yaml
pymatgen/entries/__init__.py
pymatgen/entries/compatibility.py
pymatgen/entries/computed_entries.py
pymatgen/entries/entry_tools.py
pymatgen/entries/exp_entries.py
pymatgen/entries/post_processors_abc.py
pymatgen/io/__init__.py
pymatgen/io/adf.py
pymatgen/io/aiida.py
pymatgen/io/ase.py
pymatgen/io/babel.py
pymatgen/io/cif.py
pymatgen/io/cssr.py
pymatgen/io/fiesta.py
pymatgen/io/gaussian.py
pymatgen/io/nwchem.py
pymatgen/io/pwscf.py
pymatgen/io/qchem.py
pymatgen/io/xcrysden.py
pymatgen/io/xr.py
pymatgen/io/xyz.py
pymatgen/io/zeopp.py
pymatgen/io/abinit/__init__.py
pymatgen/io/abinit/abiinspect.py
pymatgen/io/abinit/abiobjects.py
pymatgen/io/abinit/abitimer.py
pymatgen/io/abinit/calculations.py
pymatgen/io/abinit/db.py
pymatgen/io/abinit/eos.py
pymatgen/io/abinit/events.py
pymatgen/io/abinit/flows.py
pymatgen/io/abinit/helpers.py
pymatgen/io/abinit/launcher.py
pymatgen/io/abinit/mocks.py
pymatgen/io/abinit/netcdf.py
pymatgen/io/abinit/nodes.py
pymatgen/io/abinit/pseudos.py
pymatgen/io/abinit/qadapters.py
pymatgen/io/abinit/qjobs.py
pymatgen/io/abinit/qutils.py
pymatgen/io/abinit/scheduler_error_handlers.py
pymatgen/io/abinit/scheduler_error_parsers.py
pymatgen/io/abinit/strategies.py
pymatgen/io/abinit/tasks.py
pymatgen/io/abinit/utils.py
pymatgen/io/abinit/works.py
pymatgen/io/abinit/wrappers.py
pymatgen/io/feff/FeffInputSets.yaml
pymatgen/io/feff/__init__.py
pymatgen/io/feff/sets.py
pymatgen/io/lammps/NPT.json
pymatgen/io/lammps/NPT_NVT.json
pymatgen/io/lammps/NVT.json
pymatgen/io/lammps/__init__.py
pymatgen/io/lammps/data.py
pymatgen/io/lammps/force_field.py
pymatgen/io/lammps/input.py
pymatgen/io/lammps/output.py
pymatgen/io/lammps/topology.py
pymatgen/io/lammps/utils.py
pymatgen/io/vasp/GWVaspInputSet.yaml
pymatgen/io/vasp/GWvaspinputsets.py
pymatgen/io/vasp/MITRelaxSet.yaml
pymatgen/io/vasp/MPHSERelaxSet.yaml
pymatgen/io/vasp/MPRelaxSet.yaml
pymatgen/io/vasp/__init__.py
pymatgen/io/vasp/inputs.py
pymatgen/io/vasp/outputs.py
pymatgen/io/vasp/sets.py
pymatgen/matproj/__init__.py
pymatgen/matproj/rest.py
pymatgen/matproj/snl.py
pymatgen/optimization/__init__.py
pymatgen/optimization/linear_assignment.c
pymatgen/optimization/linear_assignment_numpy.py
pymatgen/phasediagram/__init__.py
pymatgen/phasediagram/analyzer.py
pymatgen/phasediagram/entries.py
pymatgen/phasediagram/maker.py
pymatgen/phasediagram/plotter.py
pymatgen/serializers/__init__.py
pymatgen/serializers/json_coders.py
pymatgen/serializers/pickle_coders.py
pymatgen/structure_prediction/__init__.py
pymatgen/structure_prediction/substitution_probability.py
pymatgen/structure_prediction/substitutor.py
pymatgen/structure_prediction/data/lambda.json
pymatgen/structure_prediction/data/pair_correlation.json
pymatgen/symmetry/__init__.py
pymatgen/symmetry/analyzer.py
pymatgen/symmetry/bandstructure.py
pymatgen/symmetry/groups.py
pymatgen/symmetry/structure.py
pymatgen/symmetry/symm_data.yaml
pymatgen/transformations/__init__.py
pymatgen/transformations/advanced_transformations.py
pymatgen/transformations/defect_transformations.py
pymatgen/transformations/site_transformations.py
pymatgen/transformations/standard_transformations.py
pymatgen/transformations/transformation_abc.py
pymatgen/util/__init__.py
pymatgen/util/convergence.py
pymatgen/util/coord_utils.py
pymatgen/util/coord_utils_cython.c
pymatgen/util/io_utils.py
pymatgen/util/num_utils.py
pymatgen/util/plotting_utils.py
pymatgen/util/string_utils.py
pymatgen/util/testing.py
pymatgen/util/structures/BaNiO3.json
pymatgen/util/structures/CsCl.json
pymatgen/util/structures/Graphite.json
pymatgen/util/structures/K2O2.json
pymatgen/util/structures/Li10GeP2S12.json
pymatgen/util/structures/Li2O.json
pymatgen/util/structures/Li2O2.json
pymatgen/util/structures/Li3V2(PO4)3.json
pymatgen/util/structures/LiFePO4.json
pymatgen/util/structures/NaFePO4.json
pymatgen/util/structures/Si.json
pymatgen/util/structures/TiO2.json
pymatgen/util/structures/VO2.json
pymatgen/vis/ElementColorSchemes.yaml
pymatgen/vis/__init__.py
pymatgen/vis/structure_vtk.py
scripts/diff_incar.py
scripts/feff_input_generation.py
scripts/feff_plot_cross_section.py
scripts/feff_plot_dos.py
scripts/gaussian_analyzer.py
scripts/gen_potcar
scripts/get_environment.py
scripts/pmg
scripts/pydii