MANIFEST.in
README.md
pyproject.toml
env/requirements.txt
env/requirements_dependent.txt
torchcell/__init__.py
torchcell/__version__.py
torchcell/cell.py
torchcell/config.py
torchcell/data_download_yeastmine.py
torchcell/dataloading_lmdb.py
torchcell/delete_subset.py
torchcell/mypy_check.py
torchcell/ncbi.py
torchcell/neo4j_example.py
torchcell/neo4j_fitness_lmdb.py
torchcell/prof.py
torchcell/py.typed
torchcell/sc_graph.py
torchcell/torchcell.mplstyle
torchcell/utils.py
torchcell.egg-info/PKG-INFO
torchcell.egg-info/SOURCES.txt
torchcell.egg-info/dependency_links.txt
torchcell.egg-info/entry_points.txt
torchcell.egg-info/requires.txt
torchcell.egg-info/top_level.txt
torchcell/adapters/__init__.py
torchcell/adapters/cell_adapter.py
torchcell/adapters/costanzo2016_adapter.py
torchcell/adapters/costanzo2016_async_adapter.py
torchcell/adapters/kuzmin2018_adapter.py
torchcell/cell/__init__.py
torchcell/data/__init__.py
torchcell/data/data.py
torchcell/data/experiment_dataset.py
torchcell/data/neo4j_cell.py
torchcell/data/neo4j_query_raw.py
torchcell/database/__init__.py
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torchcell/database/tcdb.py
torchcell/datamodels/__init__.py
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torchcell/datamodels/schema.py
torchcell/datamodules/__init__.py
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torchcell/datamodules/dcell.py
torchcell/dataset_preprocess/__init__.py
torchcell/dataset_readers/__init__.py
torchcell/dataset_readers/reader.py
torchcell/datasets/__init__.py
torchcell/datasets/add_datasets_check.py
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torchcell/datasets/cell.py
torchcell/datasets/cell_scratch.py
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torchcell/datasets/dataset_registry.py
torchcell/datasets/dcell.py
torchcell/datasets/dummy.py
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torchcell/datasets/esm2.py
torchcell/datasets/experiment.py
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torchcell/datasets/scerevisiae/tutorial_joining_nucleotide_embeddings.py
torchcell/go/__init__.py
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torchcell/graph/__init__.py
torchcell/graph/graph.py
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torchcell/graph/sgd.py
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torchcell/graph/validation/__init__.py
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torchcell/losses/__init__.py
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torchcell/sequence/__init__.py
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torchcell/sequence/sequence_scratch.py
torchcell/sequence/genome/__init__.py
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torchcell/trainers/__init__.py
torchcell/trainers/cell.py
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torchcell/trainers/dcell_regression_slim.py
torchcell/trainers/graph_convolution_regression.py
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torchcell/viz/__init__.py
torchcell/viz/fitness.py
torchcell/viz/genetic_interaction_score.py
torchcell/yeastmine/__init__.py
torchcell/yeastmine/graphs.py
torchcell/yeastmine/yeastmine.py