LICENSE
README.md
pyproject.toml
setup.cfg
src/phamerate/__init__.py
src/phamerate/__main__.py
src/phamerate.egg-info/PKG-INFO
src/phamerate.egg-info/SOURCES.txt
src/phamerate.egg-info/dependency_links.txt
src/phamerate.egg-info/entry_points.txt
src/phamerate.egg-info/requires.txt
src/phamerate.egg-info/top_level.txt
src/phamerate/classes/__init__.py
src/phamerate/classes/database.py
src/phamerate/classes/pham.py
src/phamerate/functions/__init__.py
src/phamerate/functions/clustalo.py
src/phamerate/functions/cmd.py
src/phamerate/functions/fileio.py
src/phamerate/functions/mmseqs.py
src/phamerate/functions/parallelize.py
src/phamerate/functions/utility.py