LICENSE
MANIFEST.in
README.md
pyproject.toml
setup.py
tests/test_encoding.py
tests/test_trimmed_reads.py
xengsort/_version.py
xengsort/cptasks_kmers.py
xengsort/dnaencode.py
xengsort/hash_s3c_fbcbvb.py
xengsort/kmers.py
xengsort/mask.py
xengsort/mathutils.py
xengsort/parameters.py
xengsort/srhash.py
xengsort/subtable_hashfunctions.py
xengsort.egg-info/PKG-INFO
xengsort.egg-info/SOURCES.txt
xengsort.egg-info/dependency_links.txt
xengsort.egg-info/entry_points.txt
xengsort.egg-info/not-zip-safe
xengsort.egg-info/requires.txt
xengsort.egg-info/top_level.txt
xengsort/io/fastaio.py
xengsort/io/fastqio.py
xengsort/io/generalio.py
xengsort/io/hashio.py
xengsort/io/seqio.py
xengsort/io/textio.py
xengsort/lowlevel/aligned_arrays.py
xengsort/lowlevel/bitarray.py
xengsort/lowlevel/conpro.py
xengsort/lowlevel/debug.py
xengsort/lowlevel/intbitarray.py
xengsort/lowlevel/libc.py
xengsort/lowlevel/llvm.py
xengsort/values/xenograft.py
xengsort/xengsort/xengsort_classify.py
xengsort/xengsort/xengsort_index.py
xengsort/xengsort/xengsort_load.py
xengsort/xengsort/xengsort_main.py
xengsort/xengsort/xengsort_remove.py
xengsort/xengsort/xengsort_weak.py
xengsort/xengsort/__pycache__/xengsort_classify.cpython-310.pyc
xengsort/xengsort/__pycache__/xengsort_classify.cpython-311.pyc
xengsort/xengsort/__pycache__/xengsort_index.cpython-310.pyc
xengsort/xengsort/__pycache__/xengsort_index.cpython-311.pyc
xengsort/xengsort/__pycache__/xengsort_info.cpython-311.pyc
xengsort/xengsort/__pycache__/xengsort_main.cpython-310.pyc
xengsort/xengsort/__pycache__/xengsort_main.cpython-311.pyc
xengsort/xengsort/__pycache__/xengsort_weak.cpython-310.pyc
xengsort/xengsort/__pycache__/xengsort_weak.cpython-311.pyc
xengsort/xengsort/config/classify.yaml
xengsort/xengsort/config/index.yaml