README.rst
setup.py
indel_mapper.egg-info/PKG-INFO
indel_mapper.egg-info/SOURCES.txt
indel_mapper.egg-info/dependency_links.txt
indel_mapper.egg-info/entry_points.txt
indel_mapper.egg-info/requires.txt
indel_mapper.egg-info/top_level.txt
indel_mapper_lib/__init__.py
indel_mapper_lib/alignment.py
indel_mapper_lib/aws_upload.py
indel_mapper_lib/cas9_indicator_inserter.py
indel_mapper_lib/cmdline.py
indel_mapper_lib/csv_upload.py
indel_mapper_lib/csv_writer.py
indel_mapper_lib/diff_components.py
indel_mapper_lib/indel.py
indel_mapper_lib/json_writer.py
indel_mapper_lib/mutation_cluster.py
indel_mapper_lib/presenter.py
indel_mapper_lib/presigned_post.py
indel_mapper_lib/read.py
indel_mapper_lib/read_reference_relationship.py
indel_mapper_lib/realigner.py
indel_mapper_lib/reference.py
indel_mapper_lib/reference_parser.py
indel_mapper_lib/reference_presenter.py
indel_mapper_lib/reference_processor.py
indel_mapper_lib/sam_parser.py
indel_mapper_lib/sequence.py
indel_mapper_lib/sequence_diff.py