MANIFEST.in
README.md
setup.cfg
setup.py
src/SBILoops/__init__.py
src/SBILoops.egg-info/PKG-INFO
src/SBILoops.egg-info/SOURCES.txt
src/SBILoops.egg-info/dependency_links.txt
src/SBILoops.egg-info/requires.txt
src/SBILoops.egg-info/top_level.txt
src/SBILoops/beans/Executable.py
src/SBILoops/beans/File.py
src/SBILoops/beans/IndexedNum.py
src/SBILoops/beans/JSONer.py
src/SBILoops/beans/Path.py
src/SBILoops/beans/StorableObject.py
src/SBILoops/beans/__init__.py
src/SBILoops/beans/butler.py
src/SBILoops/beans/singleton.py
src/SBILoops/data/Alphabet.py
src/SBILoops/data/AminoAcids.py
src/SBILoops/data/AtomVariants.py
src/SBILoops/data/Element.py
src/SBILoops/data/Properties.py
src/SBILoops/data/SetDict.py
src/SBILoops/data/__init__.py
src/SBILoops/databases/CATHlink.py
src/SBILoops/databases/DrugBanklink.py
src/SBILoops/databases/Enzymelink.py
src/SBILoops/databases/GOlink.py
src/SBILoops/databases/PDBTMlink.py
src/SBILoops/databases/PDBeChemConnect.py
src/SBILoops/databases/PDBeChemlink.py
src/SBILoops/databases/PDBlink.py
src/SBILoops/databases/SCOPlink.py
src/SBILoops/databases/TaxIDlink.py
src/SBILoops/databases/Uniprotlink.py
src/SBILoops/databases/__Uniprotlink.py
src/SBILoops/databases/__init__.py
src/SBILoops/databases/dblink.py
src/SBILoops/databases/uniprot/__init__.py
src/SBILoops/databases/uniprot/connect.py
src/SBILoops/databases/uniprot/uniprot.py
src/SBILoops/error/BlastError.py
src/SBILoops/error/FileError.py
src/SBILoops/error/SeqAliError.py
src/SBILoops/error/__init__.py
src/SBILoops/external/README.md
src/SBILoops/external/__init__.py
src/SBILoops/external/configSBI.txt
src/SBILoops/external/CDhit/CDhit.py
src/SBILoops/external/CDhit/CDhitExe.py
src/SBILoops/external/CDhit/CDhitHomolog.py
src/SBILoops/external/CDhit/CDhitList.py
src/SBILoops/external/CDhit/__init__.py
src/SBILoops/external/DSSP/DSSP.py
src/SBILoops/external/DSSP/DSSPExe.py
src/SBILoops/external/DSSP/__init__.py
src/SBILoops/external/blast/BlastExe.py
src/SBILoops/external/blast/BlastHit.py
src/SBILoops/external/blast/BlastResult.py
src/SBILoops/external/blast/__init__.py
src/SBILoops/external/blast/blast_parser.py
src/SBILoops/math/__init__.py
src/SBILoops/math/stats.py
src/SBILoops/sequence/Fasta.py
src/SBILoops/sequence/IndexedSeqAli.py
src/SBILoops/sequence/SeqAli.py
src/SBILoops/sequence/Sequence.py
src/SBILoops/sequence/__init__.py
src/SBILoops/sequence/alignment/Needleman_Wunsch.py
src/SBILoops/sequence/alignment/SeqAli.py
src/SBILoops/sequence/alignment/SimilarityMatrix.py
src/SBILoops/sequence/alignment/__init__.py
src/SBILoops/structure/PDB.py
src/SBILoops/structure/__init__.py
src/SBILoops/structure/parse_mmCIF.py
src/SBILoops/structure/parse_pdb.py
src/SBILoops/structure/atom/Atom.py
src/SBILoops/structure/atom/AtomOfAminoAcid.py
src/SBILoops/structure/atom/AtomOfNucleotide.py
src/SBILoops/structure/atom/AtomSeries.py
src/SBILoops/structure/atom/__init__.py
src/SBILoops/structure/chain/Chain.py
src/SBILoops/structure/chain/ChainFrame.py
src/SBILoops/structure/chain/ChainOfNucleotide.py
src/SBILoops/structure/chain/ChainOfProtein.py
src/SBILoops/structure/chain/ProteinChainFrame.py
src/SBILoops/structure/chain/__init__.py
src/SBILoops/structure/contacts/Complex.py
src/SBILoops/structure/contacts/InnerContacts.py
src/SBILoops/structure/contacts/__init__.py
src/SBILoops/structure/contacts/contact/Contact.py
src/SBILoops/structure/contacts/contact/ContactAA.py
src/SBILoops/structure/contacts/contact/ContactAH.py
src/SBILoops/structure/contacts/contact/ContactAN.py
src/SBILoops/structure/contacts/contact/__init__.py
src/SBILoops/structure/contacts/inner/PHInnerContact.py
src/SBILoops/structure/contacts/inner/PPInnerContact.py
src/SBILoops/structure/contacts/inner/__init__.py
src/SBILoops/structure/contacts/interface/Interface.py
src/SBILoops/structure/contacts/interface/PHInterface.py
src/SBILoops/structure/contacts/interface/PNInterface.py
src/SBILoops/structure/contacts/interface/PPInterface.py
src/SBILoops/structure/contacts/interface/__init__.py
src/SBILoops/structure/geometry/RMSD.py
src/SBILoops/structure/geometry/__init__.py
src/SBILoops/structure/geometry/basics.py
src/SBILoops/structure/header/BioMolecule.py
src/SBILoops/structure/header/DBreference.py
src/SBILoops/structure/header/Experiment.py
src/SBILoops/structure/header/Header.py
src/SBILoops/structure/header/HeteroAtom.py
src/SBILoops/structure/header/MiniRes.py
src/SBILoops/structure/header/Molecule.py
src/SBILoops/structure/header/SecondaryStructure.py
src/SBILoops/structure/header/Site.py
src/SBILoops/structure/header/__init__.py
src/SBILoops/structure/protein/Arch.py
src/SBILoops/structure/protein/SShelper.py
src/SBILoops/structure/protein/SecondaryStructure.py
src/SBILoops/structure/protein/Sequencer.py
src/SBILoops/structure/protein/__init__.py
src/SBILoops/structure/residue/Residue.py
src/SBILoops/structure/residue/ResidueOfAminoAcid.py
src/SBILoops/structure/residue/ResidueOfNucleotide.py
src/SBILoops/structure/residue/__init__.py